1897. április 19-én John J. McDermott (New York) megnyerte az első bostoni maratont 2:55:10 idővel.

A bostoni maraton a Bostoni Atlétikai Szövetség tagja és az amerikai olimpiai csapat vezetője, John Graham alapítója volt, akit az 1896-os athéni első modern olimpiai játékok maratonja ihlette. A bostoni üzletember, Herbert H. Holton segítségével különböző útvonalak megvizsgálták, mielőtt végül megválasztották a bostoni Irvington-ovális és a Ashlandi Metcalf-malom közötti 24,5 mérföld távolságot.

Tizenöt futó indította el a versenyt, de csak tíz ment a célba. John J. McDermott, a New York-i Pastime Athletic Club képviselője, a harvardi atléta, Dick Grant vezetésével vette át a newtoni dombokon. Bár többször sétált az utolsó mérföldek során, McDermott mégis kényelmes hat perc, ötvenkettő másodperc alatt nyert. McDermott nyerte az egyetlen másik maratont az Egyesült Államok talaján az előző októberi New York-i versenyen.

A maratoni távolságot 1908-ban az olimpiai előírásoknak megfelelően megváltoztatták, a jelenlegi 26 mérföld 385 méter hosszúságára.

A bostoni maratont eredetileg a Patriot napján, április 19-én tartották, amely egy regionális ünnep, amely a forradalmi háború kezdetét emlékezi meg. Azokban az években, amikor a 19. vasárnap esett, a versenyre a következő hétfőn került sor. 1969-ben a Hazafiak Napját hivatalosan április harmadik hétfőre helyezték át, azóta ezen a hétfőn tartják a versenyt.

A nőket 1972-ig nem engedték be hivatalosan a bostoni versenyre, de Roberta “Bobbi” Gibb nem tudta várni: 1966-ban ő lett az első nő, aki futtatta az egész Bostoni Maratont, de a kezdet közelében bokrokban kellett elbújnia. elindult a verseny. 1967-ben Kathrine Switzer, aki „K. V. Switzer ”volt az első nő, aki versenyszámmal futott. Svájc befejezte annak ellenére, hogy a tisztviselők megpróbálták fizikailag eltávolítani a versenytől, miután nőként azonosították.

1971 őszén az Amatőr Atlétikai Unió engedélyezte a szankcionált maratonokon (ideértve a Bostonot) a nők belépését. Nina Kuscsik lett az első hivatalos női versenyző, aki 1972-ben megnyerte a bostoni maratont. Hét másik nő indította el és fejezte be a versenyt.

1975-ben a bostoni maraton lett az első nagyobb maraton, amelyben kerekesszék-osztály verseny is zajlott. Bob Hall két óra, 58 perc alatt nyerte meg.